Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcnf1Q7TSH7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms