Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Actn1Q7TPR4 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms