Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Zfp397Q7TNK4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms