Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
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Mindy1Q76LS9 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mindy1Q76LS9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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