Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Cspg5Q71M36 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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