Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Topbp1Q6ZQF0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Topbp1Q6ZQF0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms