Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPS2

Carns1, Carnosine synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carns1Q6ZPS2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Carns1Q6ZPS2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Carns1Q6ZPS2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms