Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPE2

Sbf1, Myotubularin-related protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf1Q6ZPE2 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Sbf1Q6ZPE2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Sbf1Q6ZPE2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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