Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Krt9Q6RHW0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Krt9Q6RHW0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms