Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Herc4Q6PAV2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Herc4Q6PAV2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms