Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gpbp1l1Q6NZP2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gpbp1l1Q6NZP2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms