Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
NipblQ6KCD5 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms