Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Sohlh1Q6IUP1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Sohlh1Q6IUP1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms