Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Krt77Q6IFZ6 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms