Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Scaf8Q6DID3 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Scaf8Q6DID3 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms