Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nop58Q6DFW4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nop58Q6DFW4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms