Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Q6DFW0 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms