Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Sv2cQ69ZS6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sv2cQ69ZS6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms