Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Jmjd1cQ69ZK6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms