Protein–RNA interactions for Protein: Q66X22

Nlrp9b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9bQ66X22 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp9bQ66X22 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms