Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja3Q64448 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja3Q64448 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja3Q64448 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja3Q64448 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja3Q64448 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gja3Q64448 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gja3Q64448 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms