Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Irf4Q64287 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms