Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tpd52Q62393 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpd52Q62393 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpd52Q62393 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpd52Q62393 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tpd52Q62393 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms