Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sycp1Q62209 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms