Protein–RNA interactions for Protein: Q62177

Sema3b, Semaphorin-3B, mousemouse

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Length 748 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3bQ62177 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Sema3bQ62177 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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