Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sin3bQ62141 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms