Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim25Q61510 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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