Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cd53Q61451 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cd53Q61451 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cd53Q61451 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cd53Q61451 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cd53Q61451 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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Cd53Q61451 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cd53Q61451 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cd53Q61451 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Cd53Q61451 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cd53Q61451 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
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Cd53Q61451 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cd53Q61451 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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