Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nell2Q61220 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms