Protein–RNA interactions for Protein: Q60803

Traf3, TNF receptor-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3Q60803 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Traf3Q60803 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Traf3Q60803 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms