Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Bud31-206ENSMUST00000162308 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Csnk1a1-208ENSMUST00000167187 1222 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mkrn3Q60764 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms