Protein–RNA interactions for Protein: Q60698

Ski, Ski oncogene, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkiQ60698 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SkiQ60698 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SkiQ60698 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms