Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Utp20Q5XG71 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Utp20Q5XG71 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms