Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SynrgQ5SV85 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SynrgQ5SV85 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.7 ms