Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psme4Q5SSW2 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms