Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cyb5d2Q5SSH8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cyb5d2Q5SSH8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cyb5d2Q5SSH8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
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Cyb5d2Q5SSH8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cyb5d2Q5SSH8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms