Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccdc85aQ5SP85 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms