Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms