Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Fam208bQ5DTT3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Fam208bQ5DTT3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Fam208bQ5DTT3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
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Fam208bQ5DTT3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Fam208bQ5DTT3 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
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Fam208bQ5DTT3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Fam208bQ5DTT3 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
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