Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rhox3aQ4TU90 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rhox3aQ4TU90 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms