Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxn3Q499D0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Foxn3Q499D0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Foxn3Q499D0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms