Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snx25Q3ZT31 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms