Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ulk4Q3V129 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ulk4Q3V129 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms