Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
4930596D02RikQ3V0H9 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms