Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp48Q3V0C5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp48Q3V0C5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp48Q3V0C5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
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Usp48Q3V0C5 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp48Q3V0C5 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms