Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ttc9Q3V038 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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