Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn4Q3UWL8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn4Q3UWL8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pfdn4Q3UWL8 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Pfdn4Q3UWL8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Pfdn4Q3UWL8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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