Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28047Q3US59 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms