Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Sec31aQ3UPL0 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sec31aQ3UPL0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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