Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Usp19Q3UJD6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms